BSc Thesis and Research project

For English click/tap here.

Biologie en M(B)LS studenten Beta faculteit

Als je Biologie of M(B)LS aan de Beta faculteit studeert en je BSc Thesis en Research Project bij Celbiologie, Neurobiologie en Biofysica wilt doen dan kan dat natuurlijk. Wij bieden alleen plaatsen aan voor de Afstudeerproject (B-B3AFSTP), waarbij je de tijdsverdeling tussen scriptie- respectievelijk stagecomponent meestal 60/40 zal zijn. Wij bieden geen plaatsen aan voor de verlengde stage B-B3-PLONS.

De bachelor stages op onze afdeling worden in principe georganiseerd in periode 4. In groepjes van 3 of 4 studenten voer je experimenten uit bij een onderzoeker van de vakgroep.

Je schrijft individueel een verslag over het onderzoeksproject en een individuele scriptie. Het onderwerp van de scriptie is gerelateerd aan het onderzoeksproject en bepaal je samen met het leider van de onderzoeksgroep waarin je geplaatst bent. De scriptie en het verslag mag je ook combineren tot een geheel, maar dit hoeft niet.

Voor een scriptie/stage-plek gaan we uit van een denk en kennis niveau van Molecular Cell Research (B-B3MCR18), of van de cursus Research Design and Analysis (B-B3RDA21). Dit kan door die cursus te volgen (bij voorkeur) of door aan te tonen dat dit op een andere manier behaald is. Het gevolgd hebben van deze cursus is echter geen garantie voor een stageplek omdat het aantal beschikbare stageplekken op de afdeling kleiner is dan het aantal plekken in de cursus.

Als je in periode 4 je scriptie + stage wilt doen dan meld je je aan door een email te sturen naar BScCelbio@uu.nl, met de volgende informatie:

1. Naam en studentnummer
2. Welke studie volg je (Biologie/MLS/MBLS)?
3. Welke studiepaden volg je en welke N2 en N3 vakken relevant voor je stage bij CNB heb je gevolgd / ga je volgen.

Geef een top3 aan van onderzoeksleiders waar je je stage zou willen lopen (zie hier rechts op deze website, of op https://cellbiology.science.uu.nl/research-groups/). We proberen dat mee te nemen bij de toewijzing, maar bij de plaatsing houden we ook rekening met de datum van de aanvraag. Met andere woorden, als je je vroeger aanmeldt, dan is de kans groter dat je je bij de gewenste groep geplaatst wordt.

Na aanmelding laten wij je weten of je aan de ingangseisen voldoet en of er nog plaats is. Tijdens periode 3 maken we een indeling, hoor je bij welke onderzoeksgroep je definitief geplaatst wordt en wie je medestudenten zijn.

Een scriptie + stage in een andere periode kan op 3 manieren: bij Florian Berger, Ihor Smal (ervaring met programmeren wordt hier ge-eist) en de Research Hub, die door Sabrina Oliveira gerund wordt.

Bij de Research Hub is elke periode een andere onderzoeksleider betrokken die niet persé van Celbiologie komt. Per periode is voor 4 studenten Biologie plek, en hierbij werk je samen met meerdere studenten van de opleidingen scheikunde, MBLS en Farmacie.

In P1 is de groepsleider Harold MacGillavry: het ontwikkelen van nanobodies tegen neurotransmitter receptoren om hun dynamische organisatie op het neuronale membraan te onderzoeken.

In P2 is de groepsleider Dr. Apostolos Liakopoulos: het ontwikkelen van nanobodies om plasmide conjugatie tussen bacteriën te remmen. Plasmide conjugatie speelt een belangrijke rol bij het overdracht van antibiotica resistentie genen en is dus zeer relevant voor de volksgezondheid.

In P3 is de groepsleider Bert Jansen(https://www.uu.nl/medewerkers/BJCJanssen) en worden er ook weer nanobodies ontwikkeld.

In P4 is de groepsleider nog onbekend, maar zal het onderzoek gericht zijn op het ontwikkelen van assays voor het testen van de darm micro-environment. Hier zal niet aan/met nanobodies gewerkt worden.

Voor aanmeldingen bij Ihor en Florian stuur je ook een email naar BScCelbio@uu.nl; voor aanmeldingen voor de Research Hub stuur je de email (in het Engels) naar s.oliveira@uu.nl met BScCelbio@uu.nl in de CC.

In de Research Hub van Sabrina is alleen nog plek in P3, (het onderzoek wordt begeleid door Bert Janssen).

Een alternatief is wellicht een plek buiten de afdeling Biologie te zoeken. Docenten van CNB kunnen dan vaak wel optreden als de examinator van de UU en 2e beoordelaar. Benader hiervoor zelf een onderzoeksgroep en neem contact op met BScCelbio@uu.nl. Dit geldt natuurlijk voor elke periode.

Via BScCelbio@uu.nl kan je ook verdere informatie vragen.

NB: aanmelden voor stages in P4 van 2025-2026 kan pas vanaf 1 september 2025, voor die tijd zal er geen reactie op je aanvraag komen.

Stages 2024-2025
Er zijn alleen nog plekken beschikbaar bij Florian Berger (1) en Ihor Smal (2), verder zijn er geen stagemogelijkheden meer op onze afdeling. Je kunt wel zelf zoeken naar een stageplek buiten Biologie, wij kunnen dan de begeleider vanuit het departement Biologie zijn. Neem dan wel eerst contact op om af te stemmen of het onderwerp geschikt is en of wij inderdaad dit kunnen begeleiden.

Studenten van buiten de beta faculteit.
Ook hiervoor is het aantal plaatsen zeer beperkt, maar neem zelf contact op met één van de onderzoeksleiders (https://cellbiology.science.uu.nl/research-groups/) met BScCelbio@uu.nl in de CC.

Biology and M(B)LS students at Beta faculty

If you study Biology or M(B)LS at the Beta Faculty and want to do your BSc Thesis and Research Project at Cell Biology, Neurobiology and Biophysics, you can of course do so. Please note that for Biology students we only offer places for the Graduation Project (B-B3AFSTP), where your time split between thesis and internship components will usually be 60/40. We do not offer places for the extended internship B-B3-PLONS.

Undergraduate internships in our department are basically organized in quarter 4. In groups of 3 or 4 students, you will conduct experiments with a researcher from the department. You will individually write a report on the research project and an individual thesis. The topic of the thesis is related to the research project and you decide together with the leader of the research group in which you are placed. You may also combine the thesis and the report into a whole, but you do not have to.

For a thesis/internship placement, we assume a thinking and knowledge level of Molecular Cell Research (B-B3MCR18), or of the course Research Design and Analysis (B-B3RDA21). This can be done by attending one of these courses (preferably) or by demonstrating that it has been achieved by other means. However, having taken this course does not guarantee an internship position because the number of available internship spots in the department is smaller than the number of spots in the course.

If you would like to do your thesis + internship in period 4, please register by sending an email to BScCelbio@uu.nl, with the following information:

-Name and student number

-Which study are you following (Biology/MLS/MBLS)?

-Which year 2 and year 3 courses relevant to your internship at CNB have you taken/are you planning to take.

– indicate a top 3 of research leaders where you would like to do your internship (see here on the right of this website, or at https://cellbiology.science.uu.nl/research-groups/). We try to take that into account when allocating, but we also take the date of application into account when placing you. In other words, if you apply earlier, you are more likely to be placed with the desired group.

After application, we will let you know whether you meet the entry requirements and whether there is still room. During quarter 3 we will make a classification, you will hear in which research group you will be definitively placed and who your fellow students are.

A thesis + internship in another quarter then P4 can be done in three ways: with Florian Berger, Ihor Smal (experience with programming is required here) and the Research Hub, which is run by Sabrina Oliveira.

The Research Hub involves a different research leader each quarter, who is not necessarily from Cell Biology. There you work together with several students from the Chemistry, Biology, MBLS and Pharmacy program, with a maximum of 4 students per study program.

In P1, the group leader is Harold MacGillavry: developing nanobodies against neurotransmitter receptors to investigate their dynamic organization on the neuronal membrane.

In P2, the group leader is Dr Apostolos Liakopoulos: developing nanobodies to inhibit plasmid conjugation between bacteria. Plasmid conjugation plays an important role in the transfer of antibiotic resistance genes and is thus highly relevant to public health.

In P3, the group leader is Bert Jansen(https://www.uu.nl/medewerkers/BJCJanssen) and nanobodies are again being developed.

In P4, the group leader is still unknown, but the research will focus on developing assays for testing the gut microenvironment. No work will be done here on/with nanobodies.

For applications to Ihor and Florian also send an email to BScCelbio@uu.nl; for applications to the Research Hub send the email (in English) to s.oliveira@uu.nl with BScCelbio@uu.nl in the CC.

In Sabrina’s Research Hub, there is only space left in P3, (the research is supervised by Bert Janssen).

An alternative might be to find a place outside the Biology department. CNB lecturers can then often act as the UU examiner. For this, approach a research group yourself and contact BScCelbio@uu.nl. This of course applies to every period.

You can also request further information via BScCelbio@uu.nl.

NB: applying for internships in P4 from 2025-2026 is only possible from 1 September 2025, before then there will be no response to your application.

Internships 2024-2025
There are only places available at Florian Berger (1) and Ihor Smal (2), there are no more internship opportunities in the rest of our department. You can look for an internship outside of Biology yourself, we can then be the supervisor from the Department of Biology. Please contact us first to discuss whether the subject is suitable and whether we can indeed supervise this.